سیدرضا کاظمی نژاد

دانشیار

تاریخ به‌روزرسانی: 1403/12/13

سیدرضا کاظمی نژاد

دانشکده علوم / گروه زیست شناسی

رساله های دکتری

  1. ارزیابی روش های مینی سکوئنسینگ و HRM در تعیین جهش های رایج ژن PAH و بررسی علل ژنتیکی بیماران مبتلا به PKU غیر کلاسیک
    پگاه نامدار 781
  2. شناسایی و جداسازی سلول های بنیادی سرطانی از رده سلولی A2780 تخمدان و بررسی بیان ژن MAML1 در مسیر Notch و تاثیر سرکوب آن بر بیان برخی فاکتورهای مسیر EMT
    وحیده کیوانی 780
  3. بررسی بیان برخی RNAهای غیر کدگذار طویل در روند تمایز سلول های بنیادی مزانشیمی به سلول های پیش ساز ترشح کننده ی انسولین
    تینا شفاف 779
  4. بررسی روند تکاملی سلول های بنیادی مزانشیمال مشتق از بافت چربی تزریق شده به موش تورشن/دتورشن شده
    الیاسی دشتکی-معصومه 775

     مقدمه: ناباروری یکی از مهمترین مسائل بین زوجین است. در سال های اخیر محققین سلول های بنیادی را در محیط آزمایشگاهی به سلول های زایا تمایز دادند. سلول های بنیادی مزانشیمی مشتق از بافت چربی  (AT- MSCs) به واسطه روش جداسازی آسان، سالم بودن و خواص تعدیل کنندگی ایمنی بسیار مورد توجه قرار گرفتند. محدودیت مهم برای برای کاربرد این سلول ها تعداد کم و قابلیت حیات آنها است، برای غلبه بر این مشکل فاکتور های رشد زیادی مطالعه شدند. اهداف این مطالعه بررسی روند تکاملی سلول های بنیادی مزانشیمی مشتق از بافت چربی کشت شده در محیط حاوی و فاقد فاکتور های رشد اپیدرمی (EGF) مهار کننده لوکمی(LIF) و نوروتروفیک مشتق از سلول های گلیال (GDNF) بعد از پیوند به موش تورشن/ دتورشن شده می باشد.
    مواد و روش ها: AT-MSCs از موش های نر نژاد NMRI جدا شدند، ماهیت سلول ها توسط فلوسیتومتری تائید شد. بعد از عمل تورشن/دتورشن، به موش ها AT-MSCs نشان دار شده با بروموداکسی یوریدین (Brdu) که در محیط حاوی و فاقد فاکتور های رشد کشت شدند، تزریق شد. فرآیند تکاملی سلول ها با بررسی بیان شاخص های مخصوص سلول های زایا C-Kit, Mvh, Scp3, Gcnf به روش Real-time PCR و بیان پروتئین های C-KIT و GCNF به روش وسترن بلات و ردیابی سلول های نشان دار شده به روش ایمونوهیستوشیمی نشان داده شد.

    نتایج: بعد از هشت هفته مشاهده شد که تعداد زیادی از AT-MSCs پیوند شده در غشای پایه توبول های سمینی فروس ساکن شدند. بیان شاخص های سلول های بنیادی اسپرماتوگونی و اسپرماتوگونی ها Gcnf و Mvh در بیضه هایی که AT-MSCs کشت شده در محیط حاوی فاکتور های رشد پیوند شده به صورت معنی دار افزایش یافت (به ترتیب P=0.02 و P<0.001). بیان ژن های C-Kit و Scp3 تغییر معنی داری در مقایسه با گروه کنترل نشان ندادند.
    بحث: AT-MSCs می توانند درآینده برای ناباروری انسان مطالعه شوند. و استفاده از فاکتور های رشد برای کشت این سلول ها به منظور اهداف بالینی میتواند بسیارکمک کننده باشد.

     


  5. بررسی پیوستگی ژنتیکی 5 لوکوس دخیل در ناشنوایی غیر سندرمی اتوزومی مغلوب در استان خوزستان
    طهماسبی-پریسا 774

     مقدمه: ناشنوایی رایج ترین نقص حسی در انسان محسوب می شود. این بیماری هم به علل ژنتیکی و هم محیطی ایجاد می گردد که در بیش از 60درصد موارد، ژنتیکی است. ناشنوایی ژنتیکی به انواع نشانگانی و غیر نشانگانی تقسیم می گردد. بیش از 70% موارد ناشنوایی ارثی، غیرنشانگانیNSHL است که الگوی اصلی وراثت آن (80 % موارد) اتوزومی مغلوب است و به نام ناشنوایی غیر نشانگانی اتوزومی مغلوب ARNSHL خوانده می شود. هدف از مطالعه حاضر که برای نخستین بار در استان خوزستان انجام گردید، بررسی نقش لوکوس های DFNB1،DFNB2 ، DFNB4،DFNB7/11 وDFNB9 در ایجاد ناشنوایی در گروهی از خانواده های دارای ARNSHL دراین استان است.
    مواد و روش ها: این مطالعه برروی 26 خانواده دارای ناشنوایی غیرسندرمی اتوزومی مغلوب (با اولویت 4 فرد ناشنوا) در استان خوزستان انجام گردید. ابتدا بررسی جهش های ژن GJB2 با استفاده از توالی یابی مستقیم در تمام خانواده ها انجام گردید. درخانواده های منفی برای جهش های این ژن، آنالیز پیوستگی با استفاده از نشانگرهای STR (Short Tandem Repeat) مربوط به لوکوس های DFNB1،DFNB2 ، DFNB4،DFNB7/11 وDFNB9 انجام شد. ژنوتیپ مربوط به هر خانواده با استفاده از روش PCR-PAGE تعیین گردید. هم چنین رسم هاپلوتایپ و محاسبه امتیازLOD انجام گردید. توالی یابی ژن های SLC26A4 و TMC1 در خانواده های پیوسته به آن ها انجام گردید.
    نتایج : از مجموع 26 خانواده ARNSHL مورد مطالعه در این تحقیق ، پس از بررسی پیوستگی و رسم هاپلوتایپ 4 خانواده(15/38%) به لوکوس DFNB1،  دو خانواده (7/7%)به لوکوس DFNB4، یک خانواده(3/8%) به لوکوس DFNB2،، یک خانواده(3/8%) به لوکوس DFNB7/11 ،یک خانواده(3/8%) نیز به لوکوس DFNB9 پیوستگی نشان دادند. توالی یابی ژن ها در برخی خانواده های پیوسته، نتایج حاصل را تایید نمود.
    بحث و نتیجه گیری: برمبنای نتایج حاصل از پژوهش حاضر لوکوس های (DFNB1(GJB2 و DFNB4 از دلایل اصلی ARNSHLدر استان خوزستان هستند. پس از این دو، لوکوس های DFNB2، DFNB7/11وDFNB9 نیز نقش مهمی در ایجاد ناشنوایی ژنتیکی در این استان دارند و بایستی در کنار لوکوس های مذکور جهت بررسی در پانل ناشنوایی مورد توجه قرارگیرند. بی تردید نتایج این گونه تحقیقات می تواند به نحو شایانی به غربال گری ناشنوایی در جمعیت استان خوزستان و به تبع آن مشاوره ژنتیک اصولی و هم چنین تشخیص پیش از لانه گزینی (PGD) و تداخل درمانی آینده به منظور جلوگیری از آن کمک نماید.

     


پایان‌نامه‌های کارشناسی‌ارشد

  1. مطالعه همراهی دو پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی(TبهA) rs11191419 و(GبهA) rs7914558با استعداد ابتلا به اسکیزوفرنی در شهرستان دزفول.
    سارا اسماعیل پور 782
  2. بررسی بیان ژن‌های ZEB1 وPCAT1 در رده‌های سلولی مقاوم و حساس سرطان تخمدان (A2780) تیمار شده با داروی سیس‌پلاتین
    محمدرضا دباغ 782
  3. بررسی همراهی پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی rs2910164 در ژن mir-146a با بیماری روماتیسم مفصلی در استان خوزستان
    ارزو جعفری 781
  4. بررسی همراهی پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی ( T>C ) rs3746444 ژن mir-499a با بیماری روماتیسم مفصلی در استان خوزستان
    الهه جعفری 781
  5. بررسی بیان نسبی ژن CCNE1، miR193a-5p و LINC01234 در رده های سلولی مقاوم و حساس A2780 سرطان تخمدان تیمار شده با داروی سیس پلاتین
    فریما پشم فروش 780
  6. بررسی In Silico میزان بیان RNA های غیر کدگذار طویل و همراهی بیان آنها با مارکرهای EMT در سرطان آدنوکارسینومای معده
    مرضیه دایر 780
  7. مطالعه همراهی پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی rs361525 و rs1799964 ژنTNF-α با بیماری لوپوس اریتماتوس سیستمیک (SLE ) در استان لرستان .
    مهرشاد میررضایی 777
  8. بررسی مقایسه بیان hsa-mir-501-3p و hsa-mir-432-5p در مسیر انتقال پیام wnt/beta catenin بین بافت سرطانی کلورکتال و بافت مجاورسالم
    پریسا رواقی 777
  9. مقایسه میزان بیان miR-629 در نمونه های نرمال و تومور افراد مبتلا به سرطان کولورکتال
    الناز منصوری 777
  10. مقایسه میزان بیان miR-605 در نمونه‌های بافتی نرمال و تومور افراد مبتلا به سرطان سینه
    زینب حمیدی 777
  11. مقایسه میزان بیان miR-485-3p در نمونه‌های بافتی نرمال و تومور افراد مبتلا به سرطان کولورکتال
    خدیجه طاهر دنگ کو 776
  12. مقایسه میزان بیان miR34a در نمونه های نرمال و توموری افراد مبتلا به سرطان کلورکتال
    مهسا رفیعیان بروجنی 776
  13. بررسی همراهی پلی مورفیسم (rs7582694) ژن stat4 با بیماری لوپوس اریتماتوس سیستمیک (SLE) در استان لرستان
    غلامرضا ایزدخواستی 775

    مقدمه: لوپوس اریتماتوس سیستمیک (SLE) یک بیماری پلی ژنیک مولتی فاکتوریال خود ایمنی التهابی با توارث ژنتیکی پیچیده است که تقریبا همه ارگانها و سیستمهای بدن میزبان را متاثر میکند. واریانتهای پلی مورفیسمی ژنهای متعددی همچون HLA-DR، IRF، STAT4 و BLK بعنوان مارکرهای احتمالی در ایجاد استعداد و شدت این بیماری مورد توجه بوده اند. بر اساس مطالعات، ژن STAT4 یک ژن مستعد کننده است که میتواند در جمعیتهای مختلف در تکوین SLE نقش داشته باشد. پلی مورفیسمG/C (rs7582694) ژن STAT4، یکی از پلی مورفیسمهای تک نوکلئوتیدی است که با استعداد ابتلا به بیماری SLEدر بسیاری از جمعیتها همراهی نشان داده است. در مطالعه حاضر، شیوع این پلی مورفیسم در جمعیت استان لرستان بررسی شد. هدف از این مطالعه تحقیق درباره همراهی این پلی مورفیسم با بیماری لوپوس اریتماتوس سیستمیک در بیماران استان لرستان بود.

    روش کار: افراد مورد مطالعه شامل 122 فرد بیمار مبتلا به SLEو 127 فرد سالم بودند که DNAژنومی آنها استخراج شد و با دو روش PCR-RFLPو tetra-primer ARMS-PCRژنوتیپ آنها از نظر پلی مورفیسم G/C (rs7582694) تعیین گردید.

    بحث و نتیجه گیری: بر اساس نتایج بدست آمده ، فرکانس آلل اندک C این SNPبطور معنی داری در بیماران، نسبت به افراد کنترل، بالاتر بود و همراهی معنی داری را با استعداد ابتلا به SLEنشان داد (0.012P =). ژنوتیپCC، rs7582694 نیز همراهی معنی داری را با خطر SLEدر جمعیت استان لرستان نشان داد (0.042P =). همچنین بطور جداگانه فاکتورهای سرولوژیکی (anti-dsDNA و ANA)، با فرکانس ژنوتیپی بررسی شد و هیچگونه همراهی بین این فاکتورها و ژنوتیپهای rs7582694 مشاهده نگردید. بنابراین یافته های ما نشان داد که میان پلی مورفیسم G/C (rs7582694) ژن STAT4 و افزایش خطر شکل گیری بیماری SLE همراهی وجود دارد.
     


  14. مقایسه میزانMiR-21 در سرطان پستان قبل و بعد از شیمی درمانی در پلاسمای خون
    هما باغبانی 775
  15. بررسی همراهی پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی (rs2476601(+1858C>T و (rs2488457(-1123G>C در ژنPTPN22 با بیماری لوپوس سیستمیک اریتماتوس در استان لرستان.
    سیده زهرا شاهرخی 775

     
    مقدمه: لوپوس سیتمیک اریتماتوس (SLE) یک بیماری خودایمنی مزمن و سیستمیک شدید همراه با تیتر بالایی از آنتی بادی های ضدهسته ای مختلف است که بسیاری از بافت ها و اندام ها ی مختلف شامل پوست، کلیه، شش ها، قلب، مغز ومفاصل را درگیر می کند. بسیاری از عوامل کلیدی در پاتوژنز SLE دخیل هستند، برای مثال اختلال در لنفوسیت هایB و Tغالبا در بیماران مبتلا به SLE یافت می شود. ژن PTPN22، پروتئین تیروزین فسفاتاز لنفوئیدی (Lyp) را کد می کند که یک تنظیم کننده منفی سلول T می باشد. مطالعات اخیر همراهی بین پلی مورفیسم های rs2476601 وrs2488457 ژن PTPN22 و بیماری های خودایمنی مختلف از جمله SLE را نشان داده اند. در این مطالعه همراهی بین rs2476601 وrs2488457 و بیماری SLE در جمعیت استان لرستان در جنوب غربی ایران بررسی می شود.
    روش کار: 120 بیمار مبتلا به SLE و120 داوطلب سالم به عنوان گروه کنترل بررسی کردیم. DNA ژنومی جدا شد و تعیین ژنوتیپ بر اساس روش پلی مورفیسم قطعات طولی محدود           (PCR-RFLP) انجام شد.
    بحث و نتیجه گیری: نتایج نشان می دهند بین پلی مورفیسم rs2476601 و افزایش خطر ابتلا به بیماری SLE در جمعیت مورد بررسی ارتباط وجود دارد، در حالی که در مورد پلی مورفیسم rs2488457 ارتباط معنی دارمشاهده نمی شود. فراوانی الل در بیماران در مقایسه با افراد کنترل (0.663 - 0.291 =1858T (P<0.001, OR=0.44, CI 95% و                                   (1.212 - 1123C ( P = 0.307, OR = 0.811, CI 95% = 0.543می باشند. علاوه بر این، نتایج مربوط به داده های کلینیکی و آماری بیماران SLE در هر دو پلی مورفیسم بین فاکتورهای Anti-dsDNA و ANA و بروز بیماری ارتباط نشان نمی دهند.

     


  16. بررسی همراهی پلی‏ مورفیسم‏ های تک نوکلئوتیدیrs1801131 در ژن MTHFR وrs1805087 در ژن MTR با بیماری روماتیسم مفصلی در استان خوزستان.
    زینب گلبینی 775

    مقدمه: آرتریت روماتوئید (RA) یک بیماری خود ایمنی مزمن، سیتمیک و التهابی است که توسط آسیب پیشرونده مفاصل سینوویال و تظاهرات مختلف خارج مفصلی مشخص می‏ شود. هر دو عامل ژنتیکی و محیطی در بروز بیماری RAدخیل هستند. ژن MTHFR، آنزیم متیلن تتراهیدروفولات ردوکتاز و ژن MTR، آنزیم متیونین سنتاز را کد می‏کند. این آنزیم‏ها نقش‏های مهمی را در متابولیسم میتونین و هموسیستئین بازی می‏کنند. متیلاسیون نابجا و افزایش هموسیستئین در بیماران RA مشاهده شده است. در نتیجه این ژن‏ها ممکن است در پاتوژنز بیماری آرتریت روماتوئید دخیل باشند. پلی‏مورفیسم‏های rs1801131و rs1805087 در چندین جمعیت با بیماری آرتریت روماتوئید همراهی نشان داده‏اند. هدف از این مطالعه، بررسی همراهی پلی‏ مورفیسم‏ های rs1801131ژن MTHFRو rs1805087 ژن MTR با خطر ابتلا به بیماری آرتریت روماتوئید در جمعیت استان خوزستان در جنوب غربی ایران است.
    روش کار: افراد مورد مطالعه شامل 100 فرد بیمار مبتلا به RA و 120 فرد سالم می‏باشد. پس از استخراج DNA ژنومی، پلی‏ مورفیسم rs1801131 از طریق T-ARMS PCR و rs1805087توسط PCR-RFLP در افراد بیمار و کنترل تعیین ژنوتیپ گردید. سپس داده‏ها، توسط نرم افزار آماری 24.0 SPSSمورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت.
    بحث و نتیجه‏ گیری: اختلاف معناداری در فراوانی آللی پلی ‏مورفیسم‏ های rs1801131، rs1805087بین افراد بیمار و کنترل مشاهده نشد                                                                              (      1.039   - 0.407 =  P=0.256   OR=0.794   CI95%=0.534-1.182  P=0.072   OR=0.651  CI95%  ) .مقایسه ژنوتیپ‌های پلی ‏مورفیسم rs1805087نشان داد تنها ژنوتیپ AG دارای اختلاف معنادار در میان زنان بیمار و سالم است(P =0.016  ). یافته ‏های ما نشان داد آلل A از پلی‏مورفیسم rs1805087ممکن است یک فاکتور خطر ابتلا به بیماری آرتریت روماتوئید در زنان باشد. در مقابل نتایج حاکی از عدم همراهی پلی‏ مورفیسم‏ rs1801131 با استعداد ابتلا به آرتریت روماتوئید است. علاوه بر این بین ژنوتیپ و پارامترهای دیگر (سن، جنسیت، قومیت، فاکتورهای آزمایشگاهی) با خطر ابتلا به RA ارتباطی یافت نشد. نتایج قابل اعتمادتری را می‏توان با ارزیابی این پلی‏ مورفیسم‏ ها در حجم نمونه بزرگتر بدست آورد.
     


  17. : بررسی همراهی پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (rs7574865 (G/T در ژن stat4 با بیماری روماتیسم مفصلی در استان خوزستان.
    نازنین نزاراتیان 774

     مقدمه: آرتریت روماتوئید (RA) یک بیماری مزمن، سیستمیک والتهابی است. این بیماری 1% از جمعیت جهان را تحت تاثیر قرار می دهد. ژن STAT4 ، یک فاکتور رونویسی را کد می کند و یک تنظیم کننده مهم ایمن ذاتی و اکتسابی است. پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی rs7574865 در اینترون سوم ژن STAT4 ، با استعداد ابتلا به RA در چندین جمعیت همراه می باشد. هدف از این مطالعه بررسی همراهی rs7574864 در ژن STAT4 با بیماری آرتریت روماتوئید در استان خوزستان بود.
    روش کار: افراد مورد مطالعه شامل 240 نفر (120فرد بیمار مبتلا به RA و 120 فرد سالم) بودند که DNA ژنومی آنها استخراج و با روش PCR-RFLP ژنوتیپ آنها از نظر پلی مرفیسم rs7574865 در ژن STAT4 تعیین گردید.
    بحث و نتیجه گیری: نتایج بدست آمده نشان داد که از نظر آماری اختلاف معناداری میان فراوانی ژنوتیپ های افراد در هر دو گروه وجود ندارد .(p=0.916) همچنین اختلاف میان فرکانس آللها در دو گروه تفاوت معناداری نداشت (p=0.921). از طرف دیگر بررسیها نشان داد که میان نژاد و خطر شکل گیری بیماری همراهی معناداری وجود ندارد (p=0.555). علاوه بر این،یک آنالیز زیرگروه بر اساس حضور یا عدم حضورRF و Anti-CCP نشان داده است که بین ژنوتیپ های rs7574865 وAnti-CCP همراهی وجود ندارد. اما بین ژنوتیپ هایrs7574865 و RF همراهی قابل توجهی در این جمعیت وجود دارد(p=0.01).
    بنابراین یافته های ما پیشنهاد می کند که میان پلی مرفیسم STAT4 rs7574865 و استعداد ابتلا به روماتیسم مفصلی در استان خوزستان همراهی وجود ندارد.


  18. بررسی همراهی پلی مرفیسم تک نوکلئوتیدی (rs10181656(C\Gدر ژن stat4 با بیماری روماتیسم مفصلی در استان خوزستان .
    فاطمه قنواتی 774

    چکیده:
    مقدمه : آرتریت روماتوئید RA))، یک بیماری التهابی مزمن و سیستمیک است که با تخریب پیشرونده‌ی مفاصل و ایجاد آنتی بادی‌های خودی مانند آنتی بادی ضد پپتید حلقوی سیترولینه شده (ACCP) و فاکتور روماتوئید (RF) مشخص می‌شود. ژن انتقال دهنده‌ی پیام و فعال کننده رونویسی 4 (STAT4)، یک فاکتور رونویسی را کد می‌‌کند که پیام‌های القا شده‌ توسط چندین سایتوکاین التهابی را انتقال می‌دهد و نقش مهمی را در پیشرفت بیماری‌های خود ایمن بازی می‌کند. اخیرا گزارش شده است، چند پلی‌مرفیسم تک نوکلئوتیدی (SNPs) در ژن STAT4، همراهی قابل ملاحظه‌ای با بیماری آرتریت روماتوئید در جمعیت‌های متفاوت نشان می‌دهند. هدف از این مطالعه، تحقیق در مورد همراهی پلی مرفیسم rs10181656در ژن STAT4 با بیماری آرتریت روماتوئید در استان خوزستان است.

    روش کار: افراد مورد مطالعه شامل 240 نفر (120فرد بیمار مبتلا به RA و 120 فرد سالم) هستند که DNA ژنومی آن‌ها استخراج و ژنوتیپ آن‌ها از نظر پلی مرفیسم rs10181656 در ژن STAT4 با روش PCR-RFLP تعیین گردید.

    بحث و نتیجه گیری:
    نتایج بدست آمده نشان می‌دهد که از نظر آماری، همراهی معناداری میان پلی مرفیسم rs10181656 ژن STAT4 و گروه بیماران آرتریت روماتوئید و کنترل وجود دارد (0/007 :p). در حالی که در فراوانی آلل‌ها، اختلاف معناداری میان گروه های بیمار آرتریت روماتوئید و کنترل نیافتیم (0/260 :p). مقایسه ژنوتیپ‌ها نیز نشان می‌دهد تنها ژنوتیپ CG دارای اختلاف معنادار در میان این دو گروه است (0/005 :p). اگر چه یافته‌های ما پیشنهاد می‌کند این ژنوتیپ، خطر کمی در استعداد افراد به منظور شکل‌گیری و پیشرفت بیماری آرتریت روماتوئید دارد. بررسی‌ها نشان می‌دهد، که میان نژاد و خطر شکل‌گیری بیماری همراهی معناداری وجود ندارد (0/574 :p). همچنین هیچکدام از ویژگی‌های کلینیکی ( RFو Anti-CCP) با توزیع ژنوتیپی پلی‌مرفیسم rs10181656 ژن STAT4 در افراد بیمار آرتریت روماتوئید همراهی ندارند.
    بنابراین به منظور تایید ارتباط پلی مرفیسم rs10181656 ژن STAT4 و بیماری آرتریت روماتوئید در جمعیت استان خوزستان، بررسی با جمعیت نمونه بیشتر افراد بیمار و کنترل را توصیه می‌کنیم.
     


  19. بررسی همراهی پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی rs1801133)) ژن MTHFR با آرتریت روماتوئید در استان خوزستان
    شاه ولی کوه شوری-مهدی 773

    <p>مقدمه: آرتریت روماتوئید (RA) یک بیماری التهابی، سیستمیک و مزمن است که می تواند منجر به تورم و تخریب غضروف و استخوان در مفاصل گردد. واریانتهای پلی مرفیسمی ژنهای متعددی همچونHLA-DRB1وPTPN22 به عنوان مارکرهای احتمالی در ایجاد استعداد، تشدید و یا جلوگیری از بروز این بیماری مورد توجه بوده اند. پلی مرفیسم تک نوکلئوتیدی C677TژنMTHFR، یکی از پلی مرفیسمهای تک نوکلئوتیدی است که با استعداد ابتلا به بیماری RA در برخی جمعیتها همراهی نشان داده است. هدف از این مطالعه تحقیق در مورد همراهی پلی مرفیسم MTHFRC677T با بیماری آرتریت روماتوئید در بیماران ساکن استان خوزستان بود.<br /> روش کار: افراد مورد مطالعه شامل 240 نفر (120فرد بیمار مبتلا به RA و 120 فرد سالم) بودند که DNA ژنومی آنها استخراج و با روش PCR-RFLP ژنوتیپ آنها از نظر پلی مرفیسم C677T(rs1801133) تعیین گردید. <br /> بحث و نتیجه گیری: نتایج بدست آمده نشان داد که از نظر آماری اختلاف معناداری میان ژنوتیپ افراد در هر دو گروه وجود دارد .(p=0.015)همچنین اختلاف میان فرکانس آللها در دو گروه نیز به طور قابل توجهی متفاوت بود (p=0.004). از طرف دیگر بررسیها نشان داد که میان نژاد و خطر شکل گیری بیماری یک همراهی بسیار معناداری وجود دارد(p=0.001).بررسی ارتباط جداگانه میان فاکتورهای RF و Anti-CCP با خطر ابتلا به بیماری RA هیچ گونه همراهی را اثبات نکرد.<br /> بنابراین یافته های ما پیشنهاد می کند که میان پلی مرفیسم MTHFR C677T و ریسک شکل گیری بیماری RAیک همراهی وجود دارد.<br /> &nbsp;</p>


  20. مقایسه متیلاسیون ناحیه پروموتر ژن oprm1 در لنفوسیت های موش های صحرایی نر معتاد به نیکوتین ، مورفین ، متادون و بوپرونورفین
    محمد علیزاده - مائده 773

    مقدمه: اعتیاد به استفاده اجباری از دارو، بدون توجه به عواقب ناخوشایند آن اطلاق می‌شود. اعتیاد همانند سایر بیماری‌های پیچیده رایج، اختلالی چند عاملی و چند ژنی است. در مطالعات بسیاری، تاثیر اعتیاد به مواد مخدر در انسان و مدل‌های حیوانی مانند موش باعث تغییرات اپی‌ژنتیکی از جمله متیلاسیونDNA گردیده است. تغییرات اپی‌ژنتیک بوسیله برهمکنش استعدادهای ارثی، محرک محیطی و تماس با مواد مخدر در طولانی مدت بر بیان ژن تاثیر گذاشته و مستعد بروز رفتارهای اعتیاد می‌شود. متیلاسیون DNA شناخته شده‌‌ ترین مارکر اپی‌ژنتیک به شمار می‌رود. هدف از این مطالعه، بررسی اثر اپی‌ژنتیکی مواد مخدر مختلف همانند نیکوتین، مورفین، متادون و بوپرونورفین بر متیلاسیون ناحیه پروموتر ژن Oprm1 در موش‌های صحرایی نر می‌باشد.
    مواد و روشها: در مطالعه حاضر، 48 موش صحرایی نر نژاد ویستار با میانگین وزنی30 ±200 گرم و سن تقریبی 2 ماه تحت تیمار با مواد مخدر نیکوتین، مورفین، متادون، بوپرونورفین و سالین(به عنوان حلال دارو) قرار گرفتند. DNA ژنومیک از نمونه‌های خون موش‌های صحرایی استخراج شد. سپس DNA استخراج شده، تحت تیمار با سدیم بی‌سولفیت قرار گرفت. به ‌منظور شناسایی نواحی متیله شده از روش‌های PCR اختصاصی متیلاسیون و تعیین توالی استفاده شد. داده‌های حاصل با آزمون آماری Chi-squareدر نرم ‌افزار SPSS نسخه 16 آنالیز گردید.
    بحث و نتیجه‌گیری: در گروه‌های موش‌های صحرایی نر تحت تیمار با نیکوتین، مورفین، متادون، بوپرونورفین، سالین و کنترل بر روی 2 ناحیه CpG واقع در پروموتر ژن Oprm1متیلاسیون مشاهده نگردید. فراوانی نسبی متیلاسیون در گروههای مورد مطالعه صفر شد. عدم متیلاسیون این نواحی، باعث دسترسی فاکتورهای رونویسی به توالی هدف شده و بیان ژن میسر می‌گردد. در مطالعه حاضر، ارتباطی بین موش‌های صحرایی نر معتاد و متیلاسیون پروموتر ژن Oprm1 مشاهده نشد.
     


  21. بررسی همراهی پلی مورفیسم 70 bp VNTR ژن IL-4 با بیماری های خود ایمن آرتریت رماتوئیدو مولتیپل اسکلروزیس در استان خوزستان
    قریشوندی-فروزان 773

    هدف: آرتریت روماتوئید یک بیماری التهابی مزمن شایع است و علت آن التهاب شدید سینوویال است که در نهایت منجر به تخریب مفصل و ناتوانی می شود و مولتیپل اسکلروزیس یک بیماری خودایمن مزمن سیستم عصبی مرکزی است که بوسیله التهاب ، دمیلینه شدن و تحلیل آکسون ها مشخص می شود. IL-4 یکی از مهمترین ژن های سایتوکاین است که با هر دو بیماری RA و MS همراهی دارد. هدف از انجام این مطالعه ارزیابی کردن پلی مورفیسم VNTR 70 bp ژن IL-4 در بیماران خوزستانی مبتلا به آرتریت روماتوئید و مولتیپل اسکلروزیس می باشد.
    مواد و روش ها : دراین مطالعه ما نمونه خون 120 بیمار RA ، 200بیمار MS ، 120کنترل سالم برای RA و 200 کنترل سالم برای MS را جمع آوری کردیم. همه افراد در هر دو گروه کنترل به صورت تصادفی انتخاب شدند و از لحاظ سن و جنس با گروه های بیمار مطابقت داشتند. تکثیر پلی مورفیسم VNTR 70 bp ژن IL-4 بوسیله روش PCR انجام شد.
    نتایج: فراوانی های آللی و ژنوتیپی در هر گروه با هم مقایسه شدند. تفاوت آماری معنی داری در فراوانی های ژنوتیپی و آللی پلی مورفیسم VNTR 70 bp ژن IL-4بین گروه بیمار RA و کنترل وجود نداشت (p> 05/0). اما همراهی معنی داری در توزیع فراوانی های آللی و ژنوتیپی بین گروه بیمار MS و گروه کنترل مشاهده شد.(05/0 >p).
    نتیجه گیری: ما به این نتیجه رسیدیم که بین پلی مورفیسم VNTR 70 bp ژن IL-4 و بیماری آرتریت روماتوئید در میان خوزستانی ها همراهی وجود ندارد. نتیجه مشاهده شده مشابه با مطالعه ی قبلی است که بر روی بیماران چینی مبتلا به RA در تایوان انجام شده بود اما بین پلی مورفیسم VNTR 70bp ژن IL-4 و بیماری MS در میان خوزستانی ها همراهی وجود داشت.
     


  22. بررسی واژگونی اینترون 22 و مارکر HindIII در اینترون 19 ژن فاکتور 8 انعقادی در بیماران هموفیل A شدید استان کرمانشاه
    هانیه نجفی 772

    هموفیلی A بیماری انعقادی وابسته به X با شیوع تقریبی 1 در هر 5000 مرد می باشد.تقریبا نیمی از بیماران هموفیلی شدید دارای واژگونی های بزرگ DNA هستند که باعث اختلال در اینترون 22 ژن فاکتور 8 می شود. واژگونی اینترون 22 توسط روش های ساترن بلات و LD-PCR و اخیرا Inverse Shifting- PCR شناسایی می شود.هدف از انجام این مطالعه بررسی کارایی روش جدید IS-PCR به منظور شناسایی جهش شایعInv22 می باشد.همچنین در این مطالعه میزان همراهی پلی مورفیسمC/T در اینترون 19 در بیماران هموفیل شدید و افراد کنترل بررسی شد.براساس نتایج به دست آمده از روش IS-PCR ، طول قطعات تکثیری مشاهده شده ، متفاوت با نتایج موجود در مقاله اصلی به دست آمد.پس از توالی یابی قطعه تکثیرشده مشخص شد که پرایمر IU بجای اتصال به جایگاه خود، به توالی 8 نوکلئوتیدی مشابه اش در پایین دست توالی تکثیری متصل می شود.بنابراین اختلاف این قطعه تکثیر شده مشکلی در شناسایی Inv22 در افراد نرمال ایجاد نمی کند و میتوان در تشخیص ناقلین از آن بهره جست.با توجه به در دسترس نبودن توالی قطعه واژگون شده وعدم امکان مقایسه بین توالی تکثیرشده با پرایمرهای موتانت ما و توالی مورد انتظار ، امکان بررسی بیشتر جهت تعیین اختلاف سایز به دست آمده مقدور نشد. نتایج به دست آمده از همراهی پلی مورفیسم C/T نشان داد که هیچ گونه همراهی برای پلی مورفیسم C/T بین جمعیت بیمار وکنترل وجود ندارد.


  23. بررسی همراهی پلی مورفیسم ( rs 17337023 ) در اگزون 21 ژن egfr با بیماری روماتیسم مفصلی درجنوب غربی ایران
    نجمه ملک زاده گنابادی 772
  24. بررسی همراهی پلی مرفیسم تک نوکلئوتیدی، rs2476601 در ژن PTPN22 با بیماری روماتیسم مفصلی در جنوب غربی ایران.
    زهرا عباسی 771

    نام خانوادگی: عباسی نام: زهرا
    عنوان پایان نامه: بررسی همراهی پلی مرفیسم تک نوکلئوتیدی، rs2476601 در ژن PTPN22 با بیماری روماتیسم مفصلی(آرتریت روماتوئید)در جنوب غربی ایران.
    استاد راهنما: دکتر سید رضا کاظمی نژاد
    استاد مشاور اول:دکتر الهام رجایی استاد مشاوردوم:دکتر مهدی پور مهدی بروجنی
    مقطع تحصیلی: کارشناسی ارشد رشته: ژنتیک گرایش: ژنتیک
    دانشگاه: شهید چمران اهواز دانشکده: علوم
    تاریخ فارغ التحصیلی: بهمن 92
    کلمات کلیدی: SNP,LYP,PTPN22,RA T-ARMS PCR,
    مقدمه: آرتریت روماتوئید (RA) یک بیماری شایع خود ایمنی با یک زمینه ژنتیکی پیچیده است. ژن PTPN22 ،تیروزین فسفاتاز لنفوئیدی LYP را، که یک تنظیم کننده منفی قوی در روند فعال شدن سلول T میباشد را کد می کند. پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی 1858 C / T (rs2476601)، در اگزون14 از ژن PTPN22 ، با استعداد ابتلا به RA در چندین جمعیت همراه می باشد. هدف اصلی این مطالعه بررسی ارتباط بین PTPN22 (rs2476601) پلی مورفیسم و خطر ابتلا به RA در جمعیت استان خوزستان در جنوب غربی ایران بود.
    روش کار : در مجموع، 120 فرد بیمارRA ، با توجه به معیار کالج روماتولوژی آمریکا (ACR) ، و همچنین 120 کنترل از افراد ساکن استان خوزستان برای این مطالعه انتخاب شدند. ژنوتیپ نمونه های DNA ، برای C1868T از ژن PTPN22 با استفاده از روش T-ARMS PCR بررسی شد.
    بحث و نتیجه گیری : در این مطالعه ما بین پلی مورفیسم rs2476601 PTPN22 و خطر ابتلا به RA در جامعه، همراهی مشاهده نمودیم. فرکانس آلل 1858T به طور قابل توجهی در بیماران مبتلا به RAنسبت به گروه شاهد، افزایش یافته بود (P=0.009,OR=1.75,95% (CI=1.17-2.61 . ژنوتیپ CT و همچنین آلل 1858T یک عامل خطر برای ابتلا RA می باشد. از سوی دیگر اگر چه در قومیت عرب هیچ همراهی بین بیماری و آلل یافت نشد، اما در قومیت غیر عرب بین آلل خطر و بیماری همراهی معنی داری دیده شد. همچنین بین آلل های 1858T و RF و یا Anti-CCP در جمعیت خوزستان همراهی وجود دارد.
     


  25. بررسی جهش های سرطان یاب در اگزون های 2، 15، 16 و 20 ژن BRCA1 و اگزون E 11 ژن BRCA2 در بیماران مبتلا به سرطان پستان فامیلی جنوب ایران.
    صفورا دیهیمی 771
  26. بررسی جهش های شایع ژن ‏KRAS‏ در بیماران مبتلا به سرطان کلورکتال تک گیر در استان ‏خوزستان
    آسیه کازرونیان 770

    <p>&lt;p&gt;&amp;lt;p&amp;gt;مقدمه و اهداف: سرطان کلورکتال یکی از بدخیمی های شایع در جهان است. جهش های v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma (KRAS) یکی از وقایع اولیه در تکوین و پیشرفت CRC می باشد. مطالعات پیشین ثابت کرده اند که با توجه به جهش های KRAS در بیماران مبتلا به CRC متاستازی، پاسخ به درمان های هدف گیرنده فاکتور رشد اپیدرمی (EGFR) را می توان پیش بینی کرد. از این رو، در حال حاضر آزمون KRAS برای بیماران CRC به عنوان شاخصی برای درمان با آنتی بادی های ضد EGFR ضروری به نظر می رسد. کدون های 12 و 13 اگزون شماره یک، نقاط داغ جهش در این ژن هستند. در این بررسی فراوانی وقوع جهش های کدون 12 و 13 را در بیماران خوزستانیِ مبتلا به سرطان کلورکتال تک گیر (SCRC) تعیین نمودیم و با میزان آن در سایر نواحی ایران و نیز در دیگر کشورها مقایسه کردیم.&amp;lt;br /&amp;gt; روش ها: نخست DNA ژنومی از بافت های توموری 45 بیمار خوزستانی مبتلا به SCRC که عمل جراحی برداشتن تومور یا بیوپسی توسط کلونوسکوپی انجام داده بودند، استخراج شد. با روش PCR/RFLP و سپس غنی سازی جهش، جهش های نقطه ای در این دو کدون شناسایی گردید. جهش ها در ادامه با توالی یابی با روش Sanger تایید شدند. غنی سازی روش مناسبی بود که به کار برده شد تا جهش های هتروزیگوت در نمونه هایی با نسبت کم الل جهش یافته به الل سالم را نیز شناسایی کند.&amp;lt;br /&amp;gt; نتایج و بحث: 13.33% تومورها (6/45) در کدون های 12 و 13 ژن KRAS جهش داشتند. این فراوانی با اغلبِ فراوانی های به دست آمده در دیگر کشورها (33-53%) و نیز فراوانی های به دست آمده در سایر نقاط ایران (20.3% و 28%) تفاوت بسیار دارد که می تواند براساس دلایل متعددی از جمله سهم کمتر مسیر serrated در تکوین CRC در این جمعیت، بالا بودن احتمالی وضعیت ناپایداری میکروستلایتی در آن ها، حساسیت ناکافی روش غربالگری، فاکتورهای ژنتیکی و محیطی متفاوت از جمله رژیم غذایی سرشاز از امگا-3 در این جمعیت باشد. همچنین با استفاده از روش غنی سازی فرکانس الل های شناسایی شده در گروه مورد بررسی دوبرابر گشت&amp;lt;br /&amp;gt; &amp;amp;nbsp;&amp;lt;/p&amp;gt;&lt;/p&gt;</p>


  27. مطالعه همراهی دو پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی )947267 (rs18M و (3918342 (rs23M در ژن DAOA/(G72) در اختلالات اسکیزوفرنیا (SCZ)و خلقی دو قطبی (BP)در جنوب غربی ایران.
    لیلا احمدی 770
  28. مطالعه همراهی دو پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی 165688rs و 165599rs ژن COMT با اختلالات اسکیزوفرنیا (SCZ)و خلقی دوقطبی (BPD)در جنوب غربی ایران.
    پری سیما بهبهانی 770
  29. شناسایی جهش های اگزون های 3 و 8 ژن LRTOMT (DFNB63) در بیماران ناشنوای غیر سندرمی تک گیر بر اساس روش PCR-SSCP
    سیدحسین تقی زاده 770
  30. مطالعه همراهی پلی مورفیسم ( Null Mutation) در ژن گلوتاتیون-S-ترانسفراز(GSTM1,GSTT1) و دیابت ملیتوس نوع دوم در جمعیت فارس
    الهام موثر 769
  31. بررسی جهش های شایع مدیترانه ای در اگزون های 6 و 7 ژن فنیل آلانین هیدروکسیلاز در بیماران فنیل کتونوری در استان خوزستان
    ناصر عجمی 769
  32. مطالعه حذف اگزون 5 ژن NAIP در تیپ های مختلف آتروفی نخاعی - عضلانی (SMA)
    فاطمه موسوی 768
  33. بررسی پلی مورفیم DNA میتوکندریابی لاک پشت دریایی در معرض انقراض گونه عقابی (Eretmochelys inbri cata) خلیج فارس: به کمک آنالیز مارکرهای lp
    الهام مدحجی 768