گروهی از بیماری‌ها که همواره در طول تاریخ با انسان همراه بوده و مشخصه‌ی اصلی آنها رشد مهار گسیخته‌ی سلول‌ها می‌باشد را سرطان می‌نامند‌.تقریبا تمام سلول‌های بدن توانایی سرطانی شدن را دارند. لوسمی سرطانی است که لوکوسیت‌ها را تحت تاثیر قرار می‌دهد. لوکوسیت‌ها خود به دو دسته‌ی لنفوسیتی و میلوسیتی تقسیم می‌شوند. لوسمی لنفوبلاستی حاد شایع ترین سرطان در کودکان می‌باشد. ژن WWOX یک سرکوب کننده‌ی تومور می‌باشد، که جایگاه شکننده‌ی 16D در این ژن قرار دارد. rs1121404 در اینترون بین اگزون شماره‌ی 8 و 9 ژن WWOX قرار دارد. درچندین مطالعه کاهش بیانmRNA ، WWOX، در بیماران لوسمی لنفوبلاستی حاد (ALL) نسبت به گروه کنترل گزارش شده است. در مطالعه‌ا‌ی که اخیرا صورت گرفته، همراهی قابل ملاحظه‌ی rs1121404با بیماری ALL مشاهده شده است. بر همین اساس ما با بررسی نمونه‌ی خون 65 فرد مبتلا به ALL و 146 فرد سالم از استان خوزستان همراهی این پلی‌مرفیسم را با بیماری ALL به وسیله‌ی تکنیک tetra-primer ARMS-PCR مورد بررسی قرار دادیم. همچنین توالی‌یابی تعدادی از نمونه‌ها به منظور تایید نتایج انجام شد. نتایج حاصل از این پژوهش نشان داد که rs1121404 با استعداد ابتلا به بیماری ALL در استان خوزستان همراهی قابل ملاحظه‌ای (OR=2.389, P=7.20E-05) دارد.

مقدمه: هیپوهیدروتیک اکتودرمال دیسپلازی فراوان ترین نوع دیسپلازی اکتودرمی است و از طریق الگوی توارثی وابسته به X (XL)، مغلوب اتوزومی(AR) و یا غالب اتوزومی (AD) انتقال می یابد. وقوع این بیماری یک مورد از هر 10000-100000 تولد است.
جهش ها تنها در 4 ژن(EDA،EDAR،EDARADD،WNT10A) مسئول اکثر موارد بیماری هیپوهیدروتیک/انیدروتیک اکتودرمال دیسپلازی (HED) هستند. مسیر EDAR-EDA یک افکتور مهم از سیگنالینگ Wnt در تکامل ضمائم پوستی است.
روش کار: در این مطالعه4 فرد بیمار با علایم بیماری HED و اعضای خانواده ی آنها مورد بررسی قرار گرفت. نمونه خون از فرد مبتلا به بیماری هیپوهیدروتیک اکتودرمال دیسپلازیا و والدین تهیه گردید. DNA ژنومی به روش salting out استخراج سپس برای یافتن جهش و تایید بیماری زا بودن آن ، تمامی اگزون های دو ژن EDA وEDAR با تکنیک PCR تکثیر و سپس توالی یابی و آنالیز نتایج تمام اگزون های هر دو ژن و همچنین بررسی های بیوانفورماتیکی صورت گرفت.
نتیجه گیری : بر اساس آزمون های ژنتیک ملکولی، یک جهش بدمعنی، تبدیل G به A در کدون 156 اگزون 11 ژن EDA ، سبب جایگزینی آرژنین به هیستیدین می شود. همچنین جهش بدمعنی دیگری با تبدیل G به A در کدون404 اگزون 12 ژن EDAR سبب جایگزینی آلانین به ترئونین می شود.
برای تایید اثر پاتوژنیک جهش های یافت شده، PCR و تعیین ترادف در 120 نمونه ی کنترل بررسی شد.
بحث:
بر اساس نتایج آزمایشگاهی بدست آمده و آنالیزهای بیوانفورماتیکی می توان نتیجه گرفت که این سندرم در 2 بیمار مورد بررسی به دلیل جهش هایی که در ژن های EDA و EDAR صورت گرفته، ایجاد شده است.
 

 موضوع: مالتیپل اسکلروزیس یک بیماری عصبی با علت ناشناخته است که مغز و نخاع را تحت تاثیر قرار می‎دهد. ژن IL-6 یک سایتوکین مولتی‎فاکتوریال را تولید می‎کند که بسیاری از فرآیند‎های التهابی حاد و مزمن را میانجی‎گری می‎کند، و ممکن است استعداد ابتلا به MS را تحت تاثیر قرار دهد. افزایش سطوح IL-6 در خون، مایع مغزی نخاعی و ضایعات سیستم عصبی مرکزی بیماران مبتلا به MS در طی فاز حاد بیماری نشان داده شده است. داده‎ها نشان داده‎اند که برخی از پلی‎مورفیسم‎های گزارش شده در پروموتور IL-6 می‎توانند سطوح IL-6را تحت تاثیر قرار دهند. شرح منطقه‎ی پروموتوری IL-6حضور چند پلی‎مورفیسم ژنتیکی را نشان داده است: -174 (G>C)، -572 (G>C) و -597 (G>A). الل -174 C می‎تواند رونویسی IL-6 را سرکوب کند، با این حال نقش‎های عملکردی دیگر پلی‎مورفیسم‎های پروموتور IL-6 کمتر شناخته شده است. هدف از این مطالعه، بررسی پلی‎مورفیسم‏های (-174 G>C)rs1800795، (-572 G>C)rs1800796 و (-597 G>A)rs1800797 در پروموتور ژن IL-6 و آشکار کردن نقش آنها در خطر و دوره‎ی بالینی MS در گروهی از بیماران مرد برگرفته از جمعیت خوزستان می‎باشد. مواد و روش ها: در این مطالعه، 92 مرد بیمار مبتلا به MS (میانگین سنی 97/8± 84/35 سال) که بیماری آنها توسط متخصصین مغز و اعصاب طبق معیار مک دونالد تشخیص داده شده، انتخاب شدند. علاوه بر این، 92 کنترل سالم غیر‎خویشاوند (میانگین سنی03/9 ±68/34 ) مطابقت داده شدند. تجزیه و تحلیل آماری با استفاده از نرم افزار SPSS نسخه‎ی 18.00، آزمون chi-square، آزمون Mann Whitney و آزمون One-way ANOVA انجام شده بود. تعین ژنوتیپ واریانت‎های -174، -572 و -597 از طریق روش PCR-RFLP در تمامی 184 نفر انجام شد. سپس برخی از نتایج، جهت تایید توالی‎یابی شدند. نتایج: داده‎های ما نشان داد که هیچ همراهی معناداری بین توزیع ژنوتیپی IL-6pr و انواع MS، سن تشخیص بیماری و EDSS وجود ندارد. همچنین هیچ همراهی معناداری بین بیماران مبتلا به MS و افراد کنترل سالم با توجه به توزیع اللی یا ژنوتیپی -572 G>C یافت نشد(833/0P=). در حالی‎که، ارتباط معناداری بین پلی‎مورفیسم‎های -174 G/C و -597 G/A و ریسک ابتلا به MS مشاهده شد(به ترتیب؛ 019/0 P=و 05/0P=). نتیجهگیری: با توجه به اینکه همراهی معناداری بین SNP‎های rs1800795، rs1800797 در پروموتور ژن IL-6 با خطرMS وجود دارد، ما می‎توانیم این احتمال را بدهیم که این پلی‎مورفیسم‎ها ممکن است یک نقش مهم را در استعداد ابتلا به MS درجمعیت مردان خوزستانی ایفا کنند.

 مالتیپل اسکلروزیس (MS) شایع‎ترین بیماری خودایمن التهابی سیستم عصبی مرکزی (CNS) است. عوامل ژنتیکی و محیطی می‎توانند در آسیب شناسی MS نقش داشته باشند. به نظر می‎رسد سایتوکاین چندمنظوره اینترلوکین 6 (IL-6) در فرآیندهای التهابی در CNS درگیر است و نقش مهمی در پاتوژنز MS ایفا می‎کند. هدف از این مطالعه بررسی همراهی بین پلی مورفیسم‎های rs1800795، rs1800796 و rs1800797 در پروموتور ژن IL-6 با خطر ابتلا و نتایج بالینی MS در زنان استان خوزستان است. روش PCR-RFLP جهت تعیین ژنوتیپ پلی‎مورفیسم‎های پروموتور IL-6 در 206 بیمار مبتلا به MS و 206 فرد سالم به کار گرفته شد. تعدادی از نمونه‎ها تعیین توالی شدند و صحت نتایج مجددا تایید شد. نتایج با استفاده از نرم اقزار SPSS 18.0 و با بکارگیری روش‎های آماری Chi-square ، آزمون Mann-Whitney و آنالیز واریانس یک طرفه تجزیه و تحلیل شد. از نظر آماری، تفاوت معنی‎داری در توزیع ژنوتیپ‎ها و آلل‎های پلی‎مورفیسم‎های rs1800795 و rs1800797بین بیماران MS و کنترل‎ها وجود داشت. در مقابل، نتایج حاکی از عدم همراهی پلی‎مورفیسم rs1800796 با استعداد ابتلا به MS بود. جالب توجه است که این پلی‎مورفیسم همراهی معنی‎داری با مقیاس وضعیت ناتوانی گسترده (EDSS) نشان داد که نقش احتمالی این پلی‎مورفیسم را در سطح ناتوانی بیماری نشان می‎دهد. این مطالعه داده‎های جدیدی در مورد همراهی پلی‎مورفیسم‎های تک نوکلئوتیدی rs1800795 و rs1800797 با خطر ابتلا به MS و برخی علائم بالینی و همراهی rs1800796 با EDSS در جمعیت زنان استان خوزستان ارائه داده است.

مقدمه: لوسمی لنفوبلاستی حاد (ALL)، یک اختلال بدخیم از سلول¬های پیش ساز لنفوئیدی است که در کودکان و بالغین اثر دارد. میزان شیوع این بیماری در جهان، 4.75-1 در هر 100000 تولد زنده است. بیماری به وسیله¬ی افزایش بلاست¬های لوسمی که درون جریان خون گردش می¬کنند و در سرتاسر بافت¬های بدن پراکنده می¬شوند، مشخص می¬شود. B-ALL به وسیله¬ی افزایش لنفوبلاست¬هایی که در مراحل اولیه¬ی بلوغ لنفوسیت¬های B متوقف می¬شوند، مشخص می¬شود. پروفایل ژنومی، تغییرات ژنتیکی ریز میکروسکوپی را که در ایجاد ALL نقش مهمی دارند، شناسایی کرده است که از جمله¬ی آن¬ها می¬توان به تنظیم¬گر¬های رونویسی رشد لنفوسیت¬های B اشاره کرد(مثلEBF1 ،IKZF1 ، PAX5) که در بیش از دو¬ سوم از موارد B-ALL، دچار تغییر می¬شوند. از بین این فاکتورهای رونویسی، ژن PAX5 هدف عمده¬ی جهش¬های سوماتیک از جمله حذف، مضاعف شدن، ترانسلوکاسیون و جهش نقطه¬ای در B-ALL است که در یک سوم از بیماران دچار جهش می¬شود. هدف این مطالعه بررسی جهش¬های احتمالی اگزون¬های 1، 2 و 3 ژن PAX5 در بیماران مبتلا به B-ALL در استان خوزستان است.
مواد و روش¬ها: مطالعه¬ی حاضر بر روی 50 بیمار مبتلا به B-ALL انجام شد. DNA ژنومی از سلول¬های خونی استخراج شد و اگزون¬های 1، 2 و 3 ژن PAX5 با پرایمر اختصاصی تکثیر گردید. توالی¬یابی مستقیم محصولات PCR صورت گرفت و نتایج توالی¬یابی، با توالی ژن مرجع مقایسه شد.
نتایج: در کل 3 جهش در جمعیت شناسایی شد. جهش c.113G>A در اگزون و دو جهش c.212+11T>G و c.213-43T>C در اینترون یافت شدند.
بحث و نتیجه گیری: در 10 بیمار از 50 بیمار(20%) جهش شناسایی شد. این میزان فراوانی جهش در مقایسه با مطالعات گذشته در سایر کشورها، نسبتا پایین است. با این وجود، مطالعه¬ی این ژن، می¬تواند به عنوان یکی از اولین کارهای انجام شده در این زمینه، در تعیین نقش این ژن و رابطه¬اش با ALL، کمک کننده باشد.
 

لوسمی لنفوبلاستی حاد، اختلال سلول¬های پیشگام لنفوئیدی است. هر دو رده¬ی لنفوسیتی B و T در این بیماری درگیر می¬شوند ولی در بیشتر موارد لوسمی لنفوبلاستی حاد رده¬ی سلولی B را شامل می¬شود. 80% این بیماران را کودکان تشکیل می¬دهند. شیوع لوسمی لنفوبلاستی حاد کودکان در اروپا و ایالات متحده 5/3-3 در هر 100000 کودک است. آنالیز مولکولی تغییرات ژنتیکی رایج در سلول-های لوکمیک بر شناخت ما از پاتوژنز و پیش¬آگهی این سرطان موثر است. تغییرات سوماتیکی ژن فاکتور رونویسی لنفوئیدی PAX5 (BSAP نیز نامیده می¬شود) از ویژگی¬های لوسمی لنفوسیتی حاد سلول B است. ژن PAX5 روی کروموزوم 9p13.2 قرار دارد و برای متعهد شدن سلول¬های پیشگام لنفوئیدی در مسیر سلول B لازم است. این ژن در 32% موارد لوسمی لنفوسیتی حاد سلول B جهش¬یافته است.
هدف این مطالعه شناسایی جهش¬های احتمالی اگزون¬های 4، 5 و6 ژن PAX5 موثر در لوسمی لنفوسیتی حاد سلول B در استان خوزستان بود. این تحقیق 50 بیمار مبتلا به این بیماری در استان خوزستان را شامل می¬شد. نمونه خون از این بیماران گرفته و DNA استخراج شد. پس از بررسی کیفیت ژنوم استخراج شده، جهش¬های احتمالی اگزون¬های 4، 5 و 6 ژن PAX5 به وسیله¬ی PCR و توالی یابی مورد بررسی قرار گرفت. در نهایت نتایج توالی¬یابی با توالی¬های مرجع اگزون¬های 4، 5 و 6 ژن PAX5 مقایسه گردیدند.
در یک بیمار، یک پلی¬مورفیسم در اینترون 5 ژن PAX5 مشاهده شد. پلی¬مورفیسم rs7021250 در اینترون 5 ، نوکلئوتید C را به نوکلئوتید A تبدیل می¬کند. 98 نوکلئوتید بین پلی¬مورفیسم rs7021250 در اینترون 5 با آخرین نوکلئوتید این اگزون فاصله وجود داشت. در یک بیمار دیگر، دو پلی¬مورفیسم در اینترون 6 ژن PAX5 مشاهده شد. پلی¬مورفیسم rs371713875 در اینترون 6 نوکلئوتید G را به نوکلئوتید A و پلی¬مورفیسم rs368253522 در اینترون 6 نوکلئوتید C را به نوکلئوتید T تبدیل می¬کند. به ترتیب، 15 و 18 نوکلئوتید بین پلی¬مورفیسم¬های rs371713875 و rs368253522 در اینترون 6 با آخرین نوکلئوتید این اگزون فاصله وجود داشت. این پلی¬مرفیسم¬ها گزارش شده بودند.
یافته¬های ما در مورد جهش¬های احتمالی اگزون¬های 4، 5 و 6 ژن PAX5 در 50 بیمار مبتلا به لوسمی لنفوسیتی حاد سلول B در استان خوزستان، هیچ جهشی را در این سه اگزون نشان نداد. سه پلی¬مورفیسم در این جمعیت پیدا شد که این پلی¬مورفیسم¬ها در اینترون¬ها بودند. احتمالا در این جمعیت، نقاط دیگری از ژن PAX5 در بیماری¬زایی در گیر است
 

چکیده
لوسمی لنفوئیدی حاد رده سلولی B اختلال در تکثیر و تمایز لنفوسیت¬های B می¬باشد. میزان بروز سالیانه ی لوسمی لنفوئیدی حاد در جهان 3 نفر در هر 100000 نفر است. 8 درصد همه¬ی لوسمی¬ها لوسمی لنفوئیدی حاد می¬باشد (80 درصد در کودکان). ژن-های بسیار مهمی در تکامل رده¬ی لنفوئیدی B به عنوان فاکتور رونویسی عمل می¬کنند. ژن PAX5 یک ژن مهم در تکامل رده سلولیB است که موتاسیون¬های آن در چندین اختلال سلول B همراه شده با تغییرات ژنتیکی دخالت می¬کند. تغییرات ژنتیکی این ژن در 30 درصد موارد بیمار کودک و بزرگسال گزارش شده¬است. اگزون¬های 7، 8 و 9 این ژن دمین فعال کننده رونویسی را کد می¬کنند و این دمین برای عملکرد محصول این ژن بسیار حائز اهمیت می¬باشد.
هدف این مطالعه تعیین توالی اگزون های شماره 7، 8 و 9 از ژن PAX5 در نمونه های کودک B-ALL می¬باشد. نمونه¬ی خون 50 بیمار مبتلا به لوسمی لنفوئیدی حاد سلول B جمع¬آوری گردید و پس از استخراج DNA و طراحی پرایمرها برای اگزون¬های نامبرده شده، واکنش زنجیره¬ای پلی¬مراز و تعیین توالی انجام گردید.
پس از مقایسه ی نتایج حاصل از تعیین توالی با توالی¬های مرجع، مشاهده گردید در هیچکدام از بیماران موتاسیون در این قسمت ژن وجود نداشت. یک پلی¬مورفیسم تبدیل نوکلئوتید G به A(rs:35469494) در اگزون شماره 9 در 8 مورد بیمار (16 درصد کل بیماران) در موقعیت 343 پروتئین PAX5 و در موقیعت 36846913 کروموزوم 9 مشاهده گردید، که اسیدآمینه گلیسین را کد می¬کند. این پلی¬مورفیسم در 7 مورد به صورت هتروزیگوت و در 1 مورد به صورت هموزیگوت مشاهده گردید.
این موضوع بسیار مهم است که برخلاف سایر مطالعات مبنی بر وجود موتاسیون¬ها در اگزون¬های شماره 7، 8 و 9، در مطالعه ما هیچ¬گونه موتاسیون نقطه¬ای در این اگزون¬ها مشاهده نشد و بنابراین این قسمت از پروتئین از نظر موتاسیون¬های نقطه¬ای در بیماران مورد بررسی در استان خوزستان کامل و بدون نقص می¬باشد. به¬نظر می¬رسد در جمعیت مورد بررسی سایر قسمت¬های این ژن و یا سایر اشکالات این اگزون¬ها می¬تواند در بیماری زایی B-ALL نقش داشته باشد البته برای تائید این مطلب نیاز به مطالعات بیشتر می¬باشد.
 

سرطان پستان از جمله مهمترین دلایل مرگ و میر در جهان بوده و علت اصلی مرگ زنان در سنین 79-45 سالگی می باشد. اگرچه روش های رایج درمان سرطان از جمله جراحی، شیمی درمانی و رادیوتراپی تا حدی منجر به بهبود بیماری شده، اما منجر به رهایی کامل فرد نمی شوند. در سال های اخیر، ایمنی درمانی به عنوان یک شیوه نوین درمان سرطان بسیار مورد توجه قرار گرفته است چرا که بر علیه سلول های توموری اختصاصی عمل می نماید. این روش از سیستم ایمنی بدن فرد بیمار برای مبارزه با سلول های سرطانی استفاده می نماید. آنچه در این میان اهمیت دارد یافتن آنتی ژن های مناسب به منظور تولید واکسن های سرطانی می باشد. آنتی ژن های سرطان/ بیضه به دلیل الگوی بیان آن ها در طیف وسیعی از سلول های سرطانی به عنوان اهداف مناسبی به منظور تولید این واکسن ها مطرح می باشند. در این بررسی دو آنتی ژن سرطان/ بیضه SCP-1 و CAGE-1 انتخاب گردید و بیان این ژن ها در تعداد 80 نمونه بافت تومور پستان و بافت حاشیه آن ها با استفاده از تکنیک RT-PCR و NESTED_PCR بررسی شد. نتایج نشان داد که ژن SCP-1 به میزان 5/77 درصد و ژن CAGE-1 به میزان 5/2 درصد دارای بیان بود. با توجه به این نتایج و مقایسه آن ها با مطالعات قبلی انجام گرفته می توان نتیجه گرفت که SCP-1 می تواند به عنوان آنتی ژن هدف مناسبی در زمینه تولید واکسن های سرطانی مورد توجه قرار گیرد؛ اما در مورد آنتی ژن CAGE-1 نمی توان چنین نظری را ارائه نمود و با توجه به مطالعات اندک انجام شده در زمینه بیان این ژن در نمونه های بافت تومور پستان، نیاز به بررسی های بیشتری در آینده وجود دارد.

اسیدوز توبولی کلیوی یک بیماری نادر است. 4 تیپ بالینی RTA گزارش شده است. dRTA اولین RTA شناخته شده می باشد. ژن مسبب¬بیماری(¬2P13-ATP6V1B1)، کد کننده زیر واحد 1β پروتئین لیزوزومی H+-ATPase می باشد. حداقل 15 جهش در نواحی مختلف ژن ATP6V1B1 گزارش شده است. بخش قابل توجهی از بیماران دارای پیشرفت به سمت ناشنوایی حسی- عصبی هستند. در RTAتیپ 3 کاهش قابل توجهی در احیای بی کربنات فیلتر شده و ناتوانی در اسیدی شدن حداکثری ادرار با وجود درجات شدید اسیدمی سیستمیک دیده می شود. ژن مسبب بیماری (8q22-CAII) کد کننده پروتئین سیتوزولی کربنیک آنهیدراز 2 می باشد. در مطالعه حاضر، آنالیزمولکولی این دو ژن در یک خانواده با فرزند مبتلا به RTA و 50 فرد نرمال متعلق به 50 خانواده غیر مرتبط ایرانی به روش PCR بررسی گردیده است.
در این مطالعه یک کودک مبتلابه اسیدوز توبولی کلیوی ارزیابی می شود.DNA از نمونه خون بیمار، والدین وی و تمامی افراد کنترل به روش دستی Salting out استخراج شد. اگزون های ژن ATP6V1B1 و CAII توسط واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) تکثیر شدند. برای تعیین پلی مورفیسم یا جهش بودن تغییر، اگزون حاوی آن در نمونه استخراج شده از خون 50 فرد نرمال تعیین ترادف گردید.
در نتایج حاصل از تعیین ترادف خانواده ی دارای فرد مبتلا به RTA یک جهش حذفی مشکوک به بیماری زا بودن به صورت حذف یک نوکلئوتید A در کدون 405 در اگزون 12 ژنATP6V1B1 مشاهده گردید که سبب ایجاد فریم شیفت می شود. بر طبق نتایج تعیین ترادف اگزون 12 در 50 نمونه نرمال، این جهش، یک جهش جدید و بیماری زا معرفی گردید که برای اولین بار در ایران در یک خانواده ایرانی دیده شد.