صفحه اعضای هیئت علمی - دانشکده علوم
دانشیار
تاریخ بهروزرسانی: 1403/12/13
غلامرضا قزلباش
دانشکده علوم / گروه زیست شناسی
پایاننامههای کارشناسیارشد
-
بهینه سازی فعالیت آنزیم اورهآز خارج سلولی تولیدشده توسط گونه ای از آرتروباکتر و جداسازی نسبی آن
سحر صالحی 782 -
تثبیت مخلوط فلزات سنگین براساس القای میکروبی و مطالعه ی رسوب کربناتی تولید شده توسط جدایه مقاوم به فلز سنگین
پریسا اولاد 781 -
جداسازی باکتری های تولید کنننده کربونیک انیدراز از منابع محیطی و بررسی توانایی رسوب کلسیت توسط آنها
حدیث حمیدی 781 -
تولید نانوذرات فلزی توسط باکتری اسپوروسارسینا پاستوری و بررسی خواص ضد میکروبی آنها در برابر باکتری¬های مختلف
مهناز ماسپی مهر 781 -
جداسازی باکتریهای مولد اوره آز مقاوم به فلز از طبیعت و مطالعه رسوب کربنات آنها
شیوا زنگنه 780 -
جداسازی باکتری های مولد اوره آز خارج سلولی از منابع محیطی و مطالعه تولید کلسیت توسط آنها
ارزو کرمی 780 -
مطالعه رسوب کربنات فلزات سنگین توسط سلولهای فعال و در حال استراحت اسپوروسارسینا پاستوری
امل نیسی 780 -
مطالعه مقایسه ایی تولید کلسیت توسط سلول های فعال و در حال استراحت اسپوروسارسینا پاستوری
نرجس گندلی مصطفی 779 -
جداسازی و شناسایی باکتریهای نمک دوست مولد اورهآز و مطالعه کاربردهای آنها در سیمان سازی زیستی
مریم حدادی 775باکتریهای مولد آنزیم اورآز میتوانند با تولید اورهآز در حضور اوره و کلسیم نانوکریستالهای کلسیت تولید کنند. رسوب کلسیت طی فعالیت میکروبی فرایندی است که موجب سیمانی شدن ذرات خاک در طبیعت میگردد. هدف از این بررسی جداسازی باکتریهای نمک دوست مولد اورهآز به منظور رسوب کلسیت در خاکهای شور بود. نمونههای طبیعی اعم از خاک و آبهای شور برای این منظور انتخاب شدند. ابتدا با استفاده از محیطهای TSA حاوی نمک باکتریهای نمک دوست و سپس با استفاده از محیطهای اختصاصی حاوی اوره و فنل رد باکتریهای مولد اورهآز جداسازی شدند. جدایههای مولد اورهآز با آزادسازی آمونیوم موجب قلیایی شدن محیط کشت و تشکیل هاله صورتی رنگ اطراف کلنیها میشدند. بهترین جدایه بعد از سنجش آزادسازی آمونیوم به روش نسلر به منظور مطالعات بیشتر انتخاب شد. توانایی تولید نانوکریستال بر روی محیط رسوبی حاوی درصد نمکهای متفاوت به مدت 10 روز مورد بررسی قرار گرفت. مجموعا 110 جدایه نمک دوست جداسازی شدند که از این میان 58 جدایه توان تولید اورهآز را داشتند. مطالعات میکروسکوپی کلنیها نشان داد که 5 جدایه بر روی محیطهای رسوبی قادر به تولید کریستال بودند. تولید کلسیت این سویهها و خصوصیات آن طی آنالیزهای بیشتر توسط XRD و میکروسکوپ الکترونی روبشی (SEM) مجهز به EDX مورد بررسی قرار گرفت. مطالعات XRD نشان داد که ذرات کریستال کلسیت تولید شده توسط باکتریهای فوق دارای اندازه بین 60-40 نانومتر بود. همهی جدایهها بر روی محیط رسوبی کلسیت تولید کردند. سویه 3 در محیط رسوبی با 5% نمک در مقایسه با سایر جدایهها بیشترین کلسیت را نشان داد. بعلاوه این سویه در محیط رسوبی حاوی 15% نمک نیز رسوب کلسیت تولید کرد. مطالعات انجام شده بر روی سویه 6 نیز نشان داد که این باکتری قادر به رسوب کلسیت در محیط رسوبی حاوی 10 درصد نمک میباشد. این سویهها طی تستهای بیوشیمیایی و مولکولی شناسایی شدند. توالی 16S rRNA جدایههای 1، 3، 4 و 5 با استافیلوکوکوس ساپروفیتیکوس وجدایه 6 با استافیلوکوکوس زایلوسوس بیشترین تشابه را نشان دادند. آنالیز فیلوژنتیکی نشان داد که این جدایهها حدود 100-99 % تشابه به استافیلوکوکوس ساپروفیتیکوس و استافیلوکوکوس زایلوسوس دارند. این توالیها در بانک ژنومی NCBI به ترتیب با شماره دسترسی MG655151، MG655152، MG655153، MG655154 و MG655155 ثبت شدند. امروزه تلاشهای زیادی در جهت تولید سیمانهای پاک و زیستی انجام شده است و از همین رو استفاده از باکتریهای نمک دوست یا متحمل به نمک مولد اورهآز کاندیداهای مناسبی به منظور سیمان سازی زیستی در محیطهای شور میباشد.
-
جداسازی و غربالگری میکروارگانیسمهای مولد ال-آسپاراژیناز و بهینهسازی آن
فرشته قادری 774سرطانی مانند لوسمی حاد لنفوبلاستیک و لنفوسارکوما قادر به سنتز ال-آسپارژیناز نمیباشند و در نتیجه وابسته به آن در پلاسما و بافتها میباشند. آنزیم ال-آسپاراژیناز متعلق به یک گروه همولوگ از خانواده آمیدوهیدرولازها میباشد که منجر به تسریع هیدرولیز اسیدآمینه ال-آسپاراژین به ال-آسپارتات و آمونیاک میشود. بنابراین این آنزیم به طور گسترده به عنوان عامل درمانی علیه لوسمی حاد لنفوبلاستیک و لنفوسارکوما مورد استفاده قرار میگیرد. هدف از تحقیق حاضر، جداسازی میکروارگانیسمهای مولد ال-آسپاراژیناز از منابع محیطی مانند خاک، قسمتهای مختلف گیاهان، فضولات پرندگان و آب بود. بعد از انجام مرحله غربالگری و کشت در محیط اختصاصی دارای ال-آسپاراژین و معرف فنلرد به مدت 1 روز، 70 سویه در اطراف کلنی هاله بنفش تشکیل دادند. 10 جدایه توانایی بالایی از فعالیت ال-آسپاراژینازی را نشان دادند. 3 سویه برای شناسایی و بررسی فعالیت آنزیمی در منابع مختلف کربن و نیتروژن و pHانتخاب شدند. این جدایه¬ها با استفاده از خواص بیوشیمیایی و آنالیز تعیین سکانس 16S rRNA به صورت 100 Serratia marcescens، Delftia tsuruhatensis 104 وEntrobacter sp. 105 شناسایی و به ترتیب با شماره¬های دسترسی KX821734، KX821735 وKX821736 در بانک ژنی NCBI ثبت شد. بهترین شرایط تولید آنزیم برای هر سه سویه جدا شده بهینه سازی شد. کربن در سه سطح، نیتروژن در سه سطح و pH نیز در سه سطح به عنوان سطوح بینه سازی انتخاب شدند. شرایط بهینه برای تولید ال-آسپاراژیناز توسط 100 Serratia marcescen شامل انکوباسیون 20 ساعته، 5/1 درصد مالتوز به عنوان منبع کربن، 1 درصد آمونیوم سولفات به عنوان منبع نیتروژن و pH برابر 8/6 به دست آمد. همچنین شرایط بهینه برای تولید آنزیم ال-آسپاراژیناز سویه 104 Delftia tsuruhatensis، 18 ساعت انکوباسیون، 1 درصد گلوکز به عنوان منبع کربن، 5/1 درصد عصاره مخمر به عنوان منبع نیتروژن وpH برابر 7 بود. این شرایط برای Entrobacter.sp 105شامل انکوباسیون 14 ساعته، 5/1 درصد نشاسته به عنوان منبع کربن، 5/1 درصد آمونیوم سولفات به عنوان منبع نیتروژن وpH برابر 6 بود. سپس فعالیت آنزیمی ویژه ال-آسپاراژیناز توسط این سویه ها در بهترین شرایط مشخص شد. بر این اساس، 92/8، 921/9 و 42/9 واحد آنزیمی بر میلیگرم پروتئین به ترتیب برای 100 Serratia marcescens، Delftia tsuruhatensis 104 و Entrobacter sp. 105 به دست آمد. این مطالعه نشان داد که 100 Serratia marcescensوDelftia tsuruhatensis 104 فعالیت قابل ملاحظه¬ی از گلوتامینازی را نشان نمی¬دهند.