با از بین رفتن دانشگاه جندی شاپور، با یک دوره درخشان، بعد از 1200 سال مجددا در سال 1334 هجری شمسی مقدمات تاسیس دانشگاهی جدید  با همین نام در اهواز، مرکز استان خوزستان پایه ریزی شد و اولین دانشکده ی  ساخته شده در این دانشگاه دانشکده ی کشاورزی بود پس از آن آغاز ساخت دانشکده علوم در سال1343 به تصویب رسید،  شروع به کار این دانشکده  با رشته های فیزیک، ،شیمی، زیست شناسی آغاز شد. بعد از گذشت چند سال  و با اضافه شدن رشته های مختلف، دانشجویان و اساتید، نیاز به کتابخانه ی بزرگ احساس می شد، که در سال 1354 طبقه‌ی دوم سرسرای دانشکده علوم که فضای بسیار مناسب برای کتابخانه بود و طراحی آن نیز برای کتابخانه پیش بینی شده بود، به عنوان کتابخانه مرکزی دانشگاه شروع به کار کرد. و آن تنها کتابخانه دانشگاه محسوب می شد، بعد از گذشت چند سال وآماده شدن ساختمان فعلی کتابخانه مرکزی کتابخانه علوم به طور مستقل در سال  1371 کار خود را آغاز کرد.